На кафедре Мехатроники реализуются следующие образовательным программы:
Программы подготовки бакалавров
Программы подготовки магистров
Обучение осуществляется по высоким стандартам качества. В течении всего срока обучения студенты проходят рубежные контроли (каждые 2 месяца). Неотъемлемой частью учебного процесса являются регулярно проводимые олимпиады, в которых участвуют студенты кафедры.
С 2014 года на кафедре ведется обучение студентов по Совместной образовательной программе (совместно с Таллинским Техническим Университетом). Студенты этой программы на год отправляются в Эстонию на обучение и при успешном окончании обучения, получают два диплома: Университета ИТМО и Таллинского Технического Университета (диплом Евросоюза).